微滴式数字PCR技术快速精准检测苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌

作者：李辉; 姜锋; 杨春光; 姜丽; 赵鹏^*; 李鑫^*

来源：菌物学报, 2023, 1-15.

DOI：10.13346/j.mycosystema.230126

• 微滴式数字PCR
• 多年明孢盘菌
• 快速检测

为了建立苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌Neofabraea perennans微滴式数字PCR(ddPCR)检测方法，实现苹果检疫性病原菌的高效率、高精度的检疫鉴定和疫情监控，为口岸外来有害生物防控和保护我国生态安全提供技术服务和支持。本研究以N. perennans为研究对象，通过生物信息学分析确定β-微管蛋白基因(TUB2)作为靶标进行特异性引物与探针设计，通过引物和探针浓度以及退火温度的优化，构建N. perennans的ddPCR特异性检测体系。研究结果表明，N. perennans的ddPCR检测体系的绝对定量检测低限为0.16 copies/μL，最低基因组DNA检测浓度为10.0 pg/μL，与qPCR方法一致，在定量检测范围内的线性相关系数R2大于0.999，RSD 小于25%，说明该检测体系的重复性较好，能够用于进口水果样品中苹果牛眼果腐病原多年明孢盘菌N. perennans的快速精准检测。

• 单位
  真菌学国家重点实验室; 中国科学院微生物研究所; 长春工业大学人文信息学院