miR-486-3p与甲状腺乳头状癌关系的生物信息学研究

作者：赵晓海^*; 王成志; 孔建兵; 鲍跃兵; 邱永伟; 赖瑞南

来源：浙江医学, 2020, 42(20): 2180-2258.

• 甲状腺乳头状癌
• miR-486-3p
• 生物信息学分析
• 肿瘤基因图谱
• 小RNA

目的采用生物信息学方法分析miR-486-3p靶基因在甲状腺乳头状癌(PTC)中的差异表达情况及临床意义。方法根据肿瘤基因图谱中PTC肿瘤样本及配对样本的表达数据筛选miR-486-3p差异表达基因,使用Cluster Profiler R包对差异表达基因进行GO和KEGG注释,ggplot2 R包绘制GO二级分类柱形图及KEGG注释统计图,将预测miR-486-3p靶基因并与差异表达基因取交集,采用Survival R包对样本进行生存分析,绘制Kaplan-Meier生存曲线。结果共筛选出99个差异表达基因,其中74个基因上调,25个基因下调,差异表达的基因多与细胞组织结构、形态发育、ERK1/2通路等功能调控相关,主要涉及病毒感染、细胞周期、泛素化、蛋白水解、p53信号通路、细胞衰老等通路。miR-486-3p低表达的PTC患者总生存率低于高表达的患者(P<0.05)。结论 miR-486-3p可在PTC中参与调节肿瘤细胞的生物学功能,且低表达miR-486-3p的PTC患者预后不良,提示miR-486-3p或作为抑癌基因及生物标志物在PTC发生、发展中起重要作用。

• 单位
  公共卫生学院; 浙江大学; 乐清市第二人民医院