基于生物信息学分析LOXL2在肺腺癌中的表达及临床意义

作者：全静雯; 刘嘉慧; 周泉; 李林海^*

来源：分子诊断与治疗杂志, 2021, 13(04): 564-572.

DOI：10.19930/j.cnki.jmdt.2021.04.014

• LOXL2
• 肺腺癌
• 数据挖掘
• 预后

目的基于多数据库探讨LOXL2在肺腺癌中的表达水平差异和临床意义。方法利用UALCAN分析平台对LOXL2基因在TCGA数据库中的m RNA表达量进行泛癌分析;利用Oncomine和GEPIA数据库对LOXL2基因在肺腺癌中的表达进行荟萃分析;使用K-Mplot对肺腺癌中LOXL2表达量与预后关系进行分析;利用UALCAN分析LOXL2基因表达水平与临床特征的关系;使用MEXPRESS数据库对LOXL2启动子区域甲基化水平进行分析;使用String数据库构建相关蛋白网络并进行功能富集分析。结果多个数据库分析显示LOXL2在肺腺癌组织中表达水平高于正常组织(P<0.05),且与TNM分型相关;高表达LOXL2的肺腺癌患者总生存率和首次进展时间低于LOXL2低表达患者(P<0.05)UALCAN与MEXPRESS数据库分析表明,LOXL2基因启动子区域甲基化水平在肿瘤组织中较高。String数据库分析显示,MFAP5、MFAP2、FBLN5、PCOLCE、ELN、LOX、LOX1、LOX3、BMP1、TLL1等与LOXL2关系密切。结论通过挖掘并分析肿瘤基因数据库信息表明,LOXL2在肺腺癌组织中呈高表达,且与患者预后不良相关,为后续深入研究LOXL2在肺腺癌进行过程中的作用提供重要理论依据。

• 单位
  中国人民解放军南部战区总医院