多基因系统发育分析竹黄的分类地位

作者：陶欣; 赵宁; 李彪; 李敏; 闫淑珍; 陈双林^*

来源：菌物学报, 2021, 40(07): 1660-1675.

DOI：10.13346/j.mycosystema.200399

• 竹黄科
• 格孢腔菌目
• 系统发育
• 多基因
• 分类学

竹黄Shiraiabambusicola是一种重要的药用子囊菌,对其分类归属一直存在不同处理意见,主要原因在于形态分类学难以解释其不同的特征表现。为了对竹黄的分类地位做出更接近自然亲缘关系的解释,本研究以自测的S. bambusicola S4201菌株基因组为基础,结合Genome Warehouse(GWH)数据库中公布的S. bambusicola GZAAS2.1243菌株和Gen Bank数据库中公布的Shiraia sp. slf14菌株的基因组数据,选取nr SSU、nrLSU、tef-1α和rbp2 4段序列联合分析,与国际真菌生命之树计划(Assembling The Fungal TreeofLife,AFTOL)中的74种子囊菌比较,进行目级归属的系统发育分析;选择ITS、nrLSU和tub23段序列联合分析,与Gen Bank数据库中格孢腔菌目Pleosporales的30种真菌比较,进行科级归属的系统发育分析。分别采用最大似然法(maximum likelihood,ML)和贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)构建系统发育树,结果支持了单独建立竹黄科的分类处理,且竹黄科应归于格孢腔菌目,竹黄属中可能有隐存种。

• 单位
  生命科学学院; 南京市疾病预防控制中心; 南京师范大学