乙型肝炎病毒表面抗原终止密码子的偏嗜性选择

作者：李俊强; 田敬华; 刘峰; 杜绍财

来源：北京大学学报(医学版), 2008, (03): 270-272.

• 肝炎病毒
• 乙型
• 密码子
• 终止
• 序列分析 Hepatitis B virus
• Codon
• termination
• Sequence analysis

目的:探究乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)终止密码子的存在状况及偏嗜性。方法:从GenBank中选取各基因型的参考序列共174例;使用生物软件BioEdit进行序列比对,应用RNAdraw构建并分析其RNA二级结构。结果:(1)在174例参考序列中,HBsAg的终止密码子共有TAA和TGA两种形式。其中TAA形式的有124例,占71.26%;TGA形式的有50例,占28.74%。(2)终止密码子的使用存在偏嗜性,并影响RNA的二级结构和蛋白质的编码氨基酸序列。结论:HBsAg终止密码子的使用偏嗜性客观存在,可能与进化过程中RNA结构和蛋白质功能的保守性相关。

• 单位
  北京大学; 北京地坛医院; 北京大学人民医院