CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和浆细胞浸润在椎间盘退变中的生物信息学分析

作者：高一诚; 张广智; 解琪琪; 邓亚军; 任恩惠; 武作龙; 贺学岗; 康学文^*

来源：中华老年骨科与康复电子杂志, 2021, 7(04): 193-200.

• 椎间盘退变
• +T细胞" name="keyword">CD8+T细胞
• 滤泡辅助性T细胞
• 浆细胞
• CIBERSORT

目的筛选椎间盘退变(IDD)组织与非退变组织间的关键(hub)基因,并进一步分析IDD组织中免疫细胞浸润情况。方法从GEO数据库下载IDD表达谱芯片数据集,利用R软件筛选退变组织与非退变组织中的差异表达基因(DEGs),然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),筛选出hub基因。最后首次利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析IDD组织中免疫细胞的浸润情况,以揭示免疫细胞浸润在IDD中的作用。结果共筛选出166个DEGs和10个hub基因。免疫细胞浸润分析发现,IDD组织中单核细胞与调节性T细胞正相关,嗜酸性粒细胞与单核细胞和调节性T细胞负相关;CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞在IDD组织中浸润较少,而浆细胞在IDD组织中浸润则相对较多;静止期树突状细胞、浆细胞、静止期NK细胞调节性T细胞与其他免疫细胞互作较强,而滤泡辅助性T细胞、M2型巨噬细胞与幼稚性B细胞与其它免疫细胞互作较弱。结论本结果揭示了IDD中的hub基因,进一步免疫细胞浸润分析表明,CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和浆细胞与IDD发生发展密切相关,为进一步探讨IDD的分子机制提供新思路。

• 单位
  兰州大学第二医院