河南小麦品种穗粒数性状的动态变化及全基因组关联分析

作者：顾晶晶; 余慷; 陈树林; 朱保磊; 王冬至; 张爱民; 刘冬成; 詹克慧

来源：分子植物育种, 2017, 15(10): 4143-4158.

DOI：10.13271/j.mpb.015.004143

• 河南小麦
• 穗粒数
• SNP芯片
• 全基因组关联分析

穗粒数是小麦产量构成的重要因子,研究小麦穗粒数及其相关性状的变化规律与遗传机制对于高产育种具有指导意义。以198份河南种植或审定的小麦品种(系)为材料,在4个环境下鉴定穗粒数相关性状表现,选用660K SNP芯片检测材料的基因型并进行全基因组关联分析。发现穗粒数存在着广泛的变异,穗粒数、穗长、总小穗数、可育小穗数和不育小穗数的广义遗传力分别为77.43%、87.54%、85.45%、79.70%和68.08%,2002年以前、2003-2008年、2009-2014年和2015年以来育成品种的平均穗粒数分别为35.71个、36.85个、37.40个和37.98个,随着育种时期的推进总小穗数和可育小穗数也表现出逐渐提高的趋势。共发现41个和穗粒数等性状相关联的位点,分布在除了1D、3A、3D、4B和4D的16条染色体上,单个关联位点的表型变异贡献率(R2)范围为6.19%20.83%,其中10个位点至少在2个环境中稳定表达。对关联位点进一步分析发掘了多个与穗粒数性状相关的优异等位变异,如7A上AX-109368219(A)能增加穗粒数1.

• 单位
  植物细胞与染色体工程国家重点实验室; 中国科学院遗传与发育生物学研究所; 河南农业大学