《事业单位会计制度》对规范事业单位的会计核算、保证会计信息质量起到了重要作用。农业科研单位作为制度的适用单位,在农业科研项目资金管理上还有待进一步规范。笔者从农业科研项目资金管理目标着手,分析了农业科研项目资金管理存在的问题,并提出了建立健全预算编制制度、提升资金成本核算效率、强化项目资金使用效率的对策,对提升农业科研项目资金管理、促进农业科研项目可持续发展具有一定指导意义。