“沪农灵芝1号”聚酮合酶特异性分析

作者：龚明; 鲍大鹏; 唐传红; 张劲松

来源：食用菌学报, 2017, 24(04): 1-99.

DOI：10.16488/j.cnki.1005-9873.2017.04.001

• 灵芝
• 比较基因组分析
• 次级代谢
• PKS
• 通路富集分析

对"沪农灵芝1号"(简称沪灵芝)(Ganoderma lucidum SH)等10个代表性的担子菌物种进行全基因组次级代谢物(secondary metabolite,SM)簇分析,结果显示沪灵芝聚酮合酶(polyketide synthases,PKS)的骨架基因以及SM簇的数量分别为5和3,高于其它物种,并且都位于支架的末端。通过生物信息学分析发现,PKS7和9的SM簇只在沪灵芝中分布;只有PKS7的SM簇(PKS7簇)的骨架基因具有完整的I型PKS功能模块;只有PKS7簇的骨架基因具有单拷贝直系同源性;PKS7簇的功能注释基因在不饱和脂肪酸生物合成通路中富集。这些结果表明PKS7簇为沪灵芝特异性的SM簇,可能代表了沪灵芝抗逆性强的分子特征。

• 单位
  上海市农业科学院食用菌研究所; 农业部