结直肠癌患者二代测序鉴定微小RNA单核苷酸多态性位点及其对微小RNA功能的影响

作者：邱庆崇; 刘杰; 邵娇芳; 楼小燕; 陈辰; 林标扬

来源：中华肿瘤杂志, 2015, 37(10): 759-763.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2015.10.009

• 结直肠肿瘤
• 微RNAS
• 多态性,单核苷酸

目的探讨微小RNA(miRNA)相关单核苷酸多态性(SNP)与结直肠癌发生发展之间的关系。方法收集30例结直肠癌患者的癌和癌旁组织,提取基因组DNA。将癌和癌旁组织混合,应用NimbleGen私人订制的芯片对685个miRNA基因目的区域进行捕获,经过洗脱扩增处理后,采用二代测序技术对捕获区域进行深度测序,并对测序数据进行分析。结果共鉴定43个miRNA的64个SNPs,其中60个SNPs为新发现。TargetScan和mirSNP检测结果显示,hsa-mir-1273-G/A、hsamir-548h-3-C/U、hsa-mir-1290-A/G和hsa-mir-1273-C/U突变后,其成熟miRNA的表达量降低。hsamir-1268-U/C、hsa-mir-1268-C/U和hsa-mir-1285-1-U/C突变后其表达量增加。hsa-mir-376b-C/G、hsamir-604-T/C、hsa-mir-1268-T/G和hsa-mir-146a-C/G突变前后的靶基因均发生改变。mir-146a rs1052918 C>G突变促进肿瘤的发展。结论 miRNA突变影响肿瘤的发生发展,在无Wnt信号的情况下,hsa-mir-146a突变后导致Wnt信号通路一直处于激活状态,导致细胞无限增殖。

• 单位
  浙江大学