PEG胁迫下玉米转录组差异性分析

作者：赵志军; 刘延波; 李海登; 王一菲; 刘润雨; 潘春梅; 孙西玉^*

来源：种子, 2020, 39(02): 44-49.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2020.02.044

• RNA-seq
• 玉米
• PEG胁迫
• 差异表达
• 代谢通路

为了明确玉米响应PEG胁迫的关键表达基因,比较PEG胁迫下玉米基因表达的差异,本实验利用RNA-seq对正常灌溉和干旱胁迫的玉米进行转录本测序和数据分析,共获得12 358个差异表达基因,其中5 275个基因为上调表达,7 083个基因为下调表达。对差异表达基因进行COG功能分类,共得到23个不同的COG功能,其中翻译后修饰,蛋白质转换,伴随蛋白681个,占7.74%;信号传导机制功能有转录本675个,占7.67%;转录506个,占5.75%。KEGG通路显著富集到光合作用-天线蛋白、光合生物的固碳作用、卟啉和叶绿素代谢、脂肪酸降解、精氨酸和脯氨酸代谢、磷酸肌醇信号等生命代谢途径。

• 单位
  食品与生物工程学院; 河南牧业经济学院