通过数字基因表达谱和RNA测序技术鉴定自然杀伤/T细胞淋巴瘤的耐药相关基因

作者：李鑫; 程雅颂; 张旭东; 曹玲; 周志远; 孙振昌; 张明智

来源：中华实验外科杂志, 2017, 34(10): 1754-1756.

• 耐药基因
• 数字基因表达
• NK/T细胞淋巴瘤

目的筛选正常自然杀伤(NK)细胞及NK/T细胞淋巴瘤细胞株YTS、SNK-6差异表达基因,明确耐药相关基因表达。方法通过数字基因表达谱(DGE)测序技术检测正常NK细胞和NK/T细胞淋巴瘤细胞株YTS和SNK-6的DGE谱,分析3种细胞株中的差异表达基因。SNK-6细胞株与正常NK细胞比较,高表达的基因数为3 184个,低表达的基因数为2 764个;YTS细胞株与正常NK细胞比较,高表达的基因数为3 978个,低表达的基因数为2 172个;SNK-6细胞株与YTS细胞株比较,低表达的基因数为2 425个,高表达的基因数为1 068个。通过实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测常见耐药相关基因表达,建立正常NK细胞和两个NK/T细胞淋巴瘤细胞株的数字基因表达谱。结果构建正常人NK细胞和两个NK/T细胞淋巴瘤细胞株的数字基因表达谱文库,筛选3个细胞株之间的明显差异表达基因;耐药相关基因多药耐药蛋白5(ABCC5)和红白血病病毒致癌基因同系物4(ERBB4)在NK/T细胞淋巴瘤细胞株中表达升高,其中,ABCC5基因在YTS及SNK-6细胞株中的mRNA水平(3.69±0.11、5.22±1.66)明显高于正常NK细胞(1.00±0.00),差异有统计学意义(P=0.001、0.048);ERBB4基因在YTS及SNK-6细胞株中的mRNA水平(6.87±0.56、14.79±1.84)明显高于正常NK细胞(1.00±0.00),差异有统计学意义(P=0.003、0.006)。结论 ABCC5和ERBB4的高表达与NK/T细胞淋巴瘤的耐药性明显相关。

• 单位
  郑州大学第一附属医院