村民自治模式的有效性是农村社会的内生秩序和外生秩序平衡互动的结果。当前主要面临劳动输出冲击了乡村传统秩序,造成了村民自治内生秩序的改变、劳动输出造成村民自治内生秩序以及村民自治权主体空位、行政指导界限不清造成不良影响等问题。解决这类问题,需要发掘本土传统的治理价值、重构经济结构层面外生秩序、提升党组织在基层自治中的积极作用。