本发明提供一种卫星任务归并方法和系统,涉及卫星调度领域。包括以下步骤:获取所有元任务的观测时间窗和观测收益;基于观测时间窗和观测收益获取每个元任务的选择成本;基于选择成本获取元任务-观测时间窗映射集合;基于元任务-观测时间窗映射集合对单颗卫星上的所有元任务进行排序;基于预设的按序归并原则对排序后的单颗卫星上的所有元任务进行归并,得到卫星归并任务。本发明降低了卫星选择观测时间窗时的复杂度,同时提高了卫星的观测收益。