利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因

作者：吴红芬; 张颖; 侯冠彧; 王颖; 汪刘浩; 吴科榜; 那威^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(01): 182-187.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220710-20

• 文昌鸡
• 腹脂沉积
• RNA-seq
• 差异表达基因
• 候选基因

本研究利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因，旨在为低脂文昌鸡的分子育种提供理论依据。本研究结果显示，共有15 996个基因在文昌鸡腹部脂肪组织中表达，16 926个基因在儋州鸡腹部脂肪组织中表达，15 580个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中均有表达，95个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中差异表达。GO富集分析结果显示差异表达基因显著富集在细胞过程、分子活性物质运输等过程（P<0.05）。KEGG富集分析结果显示，差异表达基因在PPAR信号通路、TGF-β信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成等途径富集。通过筛选与验证，最后确定SCD、SMOC1、IGFBP2、MSMB基因为影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因。

• 单位
  动物科技学院; 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 海南大学