2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析

作者：马佳镁; 钟植文; 范悦轩; 黄春媛; 郑佳馨; 曹芳芳; 王金泉; 刘光亮; 曹宗喜

来源：新疆农业科学, 2023, 60(12): 3049-3056.

• 猪繁殖与呼吸综合征病毒
• ORF5基因
• 多重序列比对
• 同源性

【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定，利用MegAlign软件进行多重序列比对，利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV HNHK1-2021和HNLG1-2021毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为82.6%。HNHK1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR-2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对，80.8%～82.8%、90.2%～92.0%、82.1%～83.4%、81.9%～84.4%,推导氨基酸相似性分别为82.1%～84.6%、91.5%～94.5%、80.1%～83.1%、82.6%～84.6%;HNLG1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对，核苷酸相似性分别为83.7%～84.6%、81.8%～83.6%、97.7%～99.5%、85.6%～90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%～85.1%、81.1%～82.6%、96.0%～98.5%,86.1%～90.5%。【结论】2株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系3)。HNLG1-2021毒株属于VR-2332类PRRSV(谱系5)。

• 单位
  广东永顺生物制药股份有限公司; 海南省农业科学院畜牧兽医研究所; 新疆农业大学