基于转录组测序的ATPR诱导NB4细胞分化过程中lncRNA的初步鉴定与分析

作者：冯钰斌; 胡爽; 李兰兰; 徐小玲; 张梅菊; 彭晓清^*; 陈飞虎^*

来源：安徽医科大学学报, 2021, 56(06): 915-919.

DOI：10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2021.06.015

• ATPR
• NB4细胞
• 基因芯片技术
• lncRNA

目的为了探究新型维甲酸衍生物4-氨基-2-三氟甲基苯基维甲酸酯(ATPR)诱导人急性早幼粒细胞白血病NB4细胞分化的潜在作用机制。方法分别用ATPR和全反式维甲酸(ATRA)诱导NB4细胞分化,然后用基因芯片技术对处理后的细胞进行长链非编码RNA (lncRNA)和mRNA表达谱分析。结果与ATRA组比较,有775个lncRNA和904个mRNA在ATPR组被筛选出,且顺式调控基因分析了一些关键lncRNA的染色体定位。反式分析结果表明相关转录因子能调节lncRNA的表达。结论 lncRNA在ATPR诱导NB4细胞分化过程中起到重要的调节作用。

• 单位
  中国科学技术大学; 安徽医科大学