幽门螺杆菌毒力基因数字PCR检测体系的建立

作者:范宏博; 蔡永洪; 李月玥; 梁志坚; 张力玲; 马婷婷; 胡松青; 胡良勇
来源:质量安全与检验检测, 2024, 34(01): 36-41.

摘要

建立幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)毒力基因数字PCR检测体系,为Hp诊疗提供一个精准、灵敏的毒力定量检测方法。根据Hp毒力基因vacA和cagA的序列设计特异性引物和探针,采用质控菌评估检测特异性;以梯度法设置引物浓度和退火温度,对反应体系及反应条件进行优化;以梯度稀释的DNA为模板,评估检测灵敏度;采用不同浓度模板开展重复性检测,评估检测精密度。结果显示,所设计的引物和探针可特异性地检测vacA和cagA基因,不受大肠杆菌等细菌干扰。vacA和cagA基因的最佳反应温度分别为55.0℃和57.9℃,最佳引物工作浓度分别为650 nmol/L和550 nmol/L,线性分析的拟合度R2分别为0.999 1和0.999 5,不同浓度样品的变异系数(CV)值均小于10%。本研究建立的Hp毒力基因vacA和cagA数字PCR检测体系具有特异、灵敏和重复性好等优点,可为Hp病理诊疗和科学研究提供精准、可靠的技术支持。