不同取样方式对臭鳜鱼细菌多样性分析的影响

作者：钱晓庆; 张楠; 李佳鹏; 冯悦虎; 张玉^*

来源：中国调味品, 2022, 47(11): 5-12.

• 高通量测序
• 取样方式
• 臭鳜鱼
• 微生物多样性
• PCA分析

采用3种取样方式，分别取得臭鳜鱼样本的渗出液、鱼体外表面擦拭物和鱼肉组织，并利用高通量测序技术对其进行细菌多样性分析。结果表明，鱼肉组织取样方式所得样本的细菌丰度最高，其次为渗出液取样方式和鱼体外表面擦拭物取样方式。3种取样方式臭鳜鱼样本的细菌群落组成，在门水平上主要菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)和梭杆菌门(Fusobacteriota);在属水平上，鱼肉组织样品和鱼体外表面擦拭物样品的主要菌属为Psychrilyobacter和梭杆菌属(Fusobacterium),渗出液样品中主要菌属为乳杆菌属(Lactobacillus)和漫游球菌属(Vagococcus)。主成分分析(PCA)结果进一步表明，鱼肉组织和鱼体外表面擦拭物2种取样方式间细菌的多样性结果具有相似性，与渗出液取样方式细菌的多样性结果存在差异性。采用鱼肉取样可得到数量更为丰富的微生物，该研究可为分析发酵产品微生物多样性选择合适取样方式提供参考。

• 单位
  湖北工业大学