肿瘤微环境在胰腺癌中的预后分析

作者：戴云蕊; 洪坤巧; 陈军^*

来源：现代消化及介入诊疗, 2021, 26(05): 597-602.

• 胰腺癌
• 癌症基因组图谱
• 肿瘤微环境
• 免疫/基质评分
• 预后

目的探讨胰腺癌(PAAD)肿瘤微环境中与预后相关的潜在关键基因。方法自癌症基因组图谱(TCGA)下载179例PAAD患者的基因表达谱和临床资料。使用ESTIMAT算法计算基质和免疫评分,根据基质和免疫评分将其分为高分组和低分组,生成Kaplan-Meier生存曲线。然后,使用limma包筛选高分组和低分组之间的差异表达基因(DEGs)。通过韦恩图的交集找出DEGs的共同基因,利用DAVID数据库对上调基因进行功能富集分析,并使用Kaplan-Meier法验证这些基因的预后价值。结果与高免疫评分组相比,低免疫评分的患者显示出更长的中位生存期(P=0.036 9),但基质评分高低分组之间的预后没有统计学差异。高分组47个基因通常被上调,而低分组722个基因通常被下调,且47个上调基因中的31个与不良预后显著相关的基因。此外,发现LOC389332、ZDHHC8P1、WNK4、TLE6、DDC与肿瘤关系密切。功能富集分析显示上调基因主要参与细胞外基质、免疫应答和细胞黏附。结论低免疫评分的患者显示出更长的中位生存期,本研究发现有31个与不良预后显著相关的基因,且LOC389332、ZDHHC8P1、WNK4、TLE6、DDC与肿瘤关系密切,这些基因的进一步研究可能是有价值的,有助于理解PAAD和微环境之间的相互作用,提供潜在的治疗靶点。

• 单位
  武汉大学人民医院