高通量测序解析烟草苗床期基质细菌和真菌群落结构与多样性变化

作者：罗飞; 李文红^*; 刘亭亭; 汪汉成; 孙美丽; 蔡刘体; 穆青; 余知和

来源：中国烟草学报, 2023, 29(02): 79-88.

DOI：10.16472/j.chinatobacco.2022.T0066

• 苗床期
• 育苗基质
• Illumina MiSeq高通量测序
• 群落结构
• 烟苗
• 微生物多样性

【背景和目的】烟苗的生长发育状况与育苗基质微生物密切相关，为了解烟苗育苗阶段基质细菌和真菌群落结构与多样性特征。【方法】采用IlluminaMiSeq高通量测序对育苗基质中细菌和真菌群落进行测序与分析。【结果】不同育苗阶段基质（播种后第10～66 d）真菌和细菌在菌群结构及相对丰度均存在差异。基质中优势细菌门均为变形菌门Proteobacteria(65.60%～72.80%)、拟杆菌门Bacteroidetes(16.75%～21.35%)和酸杆菌门Acidobacteria(1.38%～4.67%)；优势细菌属均为德沃斯氏菌属Devosia(4.81%～14.20%)、罗河杆菌属Rhodanobacter(1.60%～6.19%)、戴氏菌属Dyella(0.38%～8.92%)等，其中，德沃斯氏菌属和罗河杆菌属在播种第66 d的相对丰度较第10 d分别降低8.6%和3.31%。播种第38 d基质细菌Shannon多样性指数和ACE丰富度指数最低，分别为7.25和1161.10；播种第24 d和66 d基质细菌Shannon多样性指数最高，分别为8.15和8.01。基质中优势真菌门均为子囊菌门Ascomycota(16.84%～23.55%)、担子菌门Basidiomycota(4.93%～11.95%)和Aphelidiomycota(0.04%～5.32%)；优势真菌属均为假裸囊菌属Pseudogymnoascus(0.42%～11.63%)、节丛孢属Arthrobotrys(0.28%～14.29%)、革菌属Tomentella(0.21%～8.96%)等，其中，节丛孢属和革菌属在播种第52 d的相对丰度较第10 d分别提高14.01%和8.57%。播种第24 d基质真菌Shannon多样性指数最低，为3.93；播种第10 d和52 d基质真菌Shannon多样性指数最高，分别为5.57和5.86。功能预测显示，播种66 d内烟苗基质细菌主要功能分布在代谢类、遗传信息处理类和环境信息处理类等；真菌主要功能分布在腐生类和外生菌根类。【结论】烟草苗床期基质细菌和真菌群落种类无显著变化，但其相对丰度与多样性指数在不同育苗阶段存在差异。

• 单位
  贵州省烟草公司黔西南州公司; 贵州省烟草科学研究院; 长江大学; 贵州省农业科学院植物保护研究所; 生命科学学院