基于BSA-seq技术的辣椒分枝QTL定位

作者：宋拉拉; 苏丹; 白立伟; 夏忠敏; 陈锡; 胡明文

来源：分子植物育种, 2023, 1-18.

• 辣椒
• 分枝
• BSA-seq
• QTL定位

分枝是辣椒(Capsicum annuum L.)重要的农艺性状之一，不仅影响辣椒产量的多少，也是观赏效果的重要因素。本研究以独杆辣椒(du-1)、簇生朝天椒(S16)及它们的F2代分离群体为材料，构建亲本及F2代辣椒分枝极端混池，利用BSA-seq技术，筛选辣椒分枝性状的QTLs。结果显示，SNP与InDel关联区域取其交集，得到9个与性状相关的候选区域，总长度为21.53 Mb，主要集中在1号染色体上。同时，利用BLAST软件对候选区间内编码基因进行多个数据库深度注释，共注释到121个基因，其中非同义突变基因31个，移码突变基因5个。结合候选区域内基因的GO富集和KEGG富集分析，筛选出与辣椒分枝性状相关候选基因7个。以上结果为进一步辣椒分枝性状基因克隆和分子标记辅助育种提供基础。

• 单位
  贵州省农业科学院; 贵州省草业研究所