苹果砧木‘SH6’叶绿体基因组序列特征和比较分析

作者：邓玉林; 王森^*; 郑轶; 姚允聪

来源：北京农学院学报, 2023, 38(03): 23-33.

DOI：10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2023.0305

• 苹果砧木‘SH6’
• 叶绿体基因组
• 序列特征分析

【目的】为了解析苹果矮化中间砧‘SH6’叶绿体基因组特征及其进化关系。【方法】以苹果矮化中间砧‘SH6’为试材，通过HIFI测序，利用Organelle＿PBA软件进行叶绿体基因组从头组装，分析其叶绿体基因组特征。【结果】结果表明，‘SH6’叶绿体基因组大小为160 069 bp,具有典型的四分结构，包括大单拷贝区域、小单拷贝区域和两个反向重复区域，长度分别为88 184 bp、19 181 bp、26 352 bp和26 352 bp。在‘SH6’叶绿体基因组中，分别注释了蛋白质编码基因、tRNA和rRNA,其数量分别为86、36和8。此外，整合已发表的‘国光’、河南海棠、2个野生苹果和桃(Prunus persica)的叶绿体基因组数据来构建系统发育树，发现苹果中间砧‘SH6’与欧洲森林苹果聚在一枝上。【结论】推测苹果矮化中间砧品种‘SH6’与欧洲森林苹果关系较为密切。

• 单位
  北京农学院