棉花EST-SSR新标记特征及其遗传多样性分析

作者：梁维维; 张大伟; 陈全家; 曲延英; 高文伟

来源：新疆农业大学学报, 2013, (02): 118-123.

• 棉花
• EST-SSR
• 标记开发
• 聚类分析 cotton
• EST-SSR
• marker development
• cluster analysis

利用棉花EST序列数据库开发EST-SSR标记,对108 558条棉花EST序列进行SSR搜索,针对286条含有SSR的EST序列设计合成了107对引物,选用12个棉花品种进行有效性检测。结果表明,在陆地棉EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸占主导地位,所占比例分别为32.0%和53.6%;出现最多的重复基元是AT/TA,占总数的19.6%;在海岛棉EST-SSR中,三核苷酸和六核苷酸占主导地位,所占比例分别为36.6%和36.8%;出现最多的重复基元是AT/TA,占总数的7.4%。PCR检测表明,93个引物对(86.9%)可以扩增出稳定清晰条带458条,平均每对引物检测到4.93个位点。利用...

• 单位
  新疆农业大学; 新疆农业科学院经济作物研究所