SSR标记在毛木耳种质资源遗传多样性研究中的应用

作者：姚方杰^*; 黄程远; 孔祥会; 王鹏; 鲁丽鑫; 方明; 张友民

来源：菌物学报, 2019, 38(12): 2122-2132.

DOI：10.13346/j.mycosystema.190139

• 聚类分析
• 遗传差异
• 子实体颜色
• 野生菌株
• 栽培菌株

本研究利用基于毛木耳全基因组开发的SSR标记对27份毛木耳菌株(野生14株、栽培13株)的遗传多样性进行分析。首先随机选取3个菌株(2个野生菌株、1个栽培菌株)的DNA为模板,从144对SSR引物中筛选出扩增条带清晰、稳定性强、多态性丰富的引物24对。24对SSR引物共检测到116个多态性SSR片段,每对引物的多态性片段有3–7个,引物平均检测效率为4.83个,Shannon’s遗传多样性指数范围是0.866–1.885,多态性位点比率100%。供试菌株遗传相似系数范围是0.618–0.971,说明毛木耳种质资源具有丰富的遗传多样性。野生菌株与栽培菌株间平均遗传相似系数分别为0.746、0.779,说明毛木耳野生菌株遗传多样性更为丰富。经聚类分析,在遗传相似系数为0.680时,可将供试菌株分为无色(白色)类群Ⅰ和有色(浅黄色到红褐色)类群Ⅱ。遗传相似系数为0.704时,可将供试菌株中栽培菌株和野生菌株明显区分(14株野生菌株均在类群Ⅱ-2中,13株栽培菌株分别在类群Ⅰ和Ⅱ-1中)。本研究表明基于全基因组的SSR标记能从分子水平上揭示各菌株间的遗传差异,丰富毛木耳遗传多样性的研究手段,并为进一步进行毛木耳的品种选育、遗传学研究等提供有力手段。

• 单位
  吉林农业大学