针对不确定性条件下高超声速飞行偏差演化问题,提出一种基于随机配点法的偏差演化分析方法。在分析高超声速飞行偏差主要来源的基础上,综合考虑计算精度和分析效率,基于广义多项式混沌理论,采用随机配点方法进行偏差演化计算,进一步给出随机配点生成的稀疏网格技术。数值仿真表明,随机配点法的引入有效解决了高超声速飞行器系统偏差演化问题,可为工程设计提供有益参考。