基于连接酶检测反应的基因芯片分型技术的建立

作者：肇旭; 秦胜营; 冯国鄞; 贺林

来源：国际遗传学杂志, 2006, (03): 178-182.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2006.03.005

• 基因芯片
• 连接酶检测反应
• 分型 DNA chip
• Ligase detection reaction
• Genotyping

目的建立基于连接检测反应的基因芯片分型技术。方法将连接检测反应,通用芯片技术及片基异硫氰基化从头活化方法相结合。结果应用测序技术验证,该方法分型准确性达到100%。另外也不会产生非模板依赖性信号,对未纯化模板的分型效果也较好。结论连接检测反应能够在高温下进行,显著减少了探针非特异性连接;其通用性使得研究者可基于一张芯片自由选择所研究的位点,无需针对每一组探针进行操作条件的单独优化,并且保证了杂交的特异性;片基从头活化技术更使其摆脱了对商品化片基的依赖。这些特点都极大地提高了该技术的分型准确性,并且降低了费用,使其应用于高通量SNP分型成为可能。

• 单位
  中国科学院; 上海市精神卫生中心; 上海交通大学