秦川牛A-FABP基因的生物信息学分析

作者：季舒涵; 昝林森; 王洪宝; 刘艳妍

来源：西北农林科技大学学报(自然科学版), 2010, (06): 77-82.

• A-FABP基因
• 生物信息学
• 秦川牛 A-FABP gene
• bioinformatics
• Qinchuan cattle

【目的】克隆秦川牛脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因,并对其进行生物信息学分析,为深入研究A-FABP基因与秦川牛肉质性状的关系奠定基础。【方法】以秦川牛脂肪组织为材料,采用RT-PCR方法对牛A-FABP基因进行克隆。使用DNAMAN、NCBI等一系列在线软件及工具,对所得到的序列及其编码蛋白质的结构和特性等进行生物信息学分析。【结果】秦川牛A-FABP基因含有15个酶切位点,编码的蛋白分子质量为14.7 ku,二级结构主要以α-螺旋、不规则盘绕和延伸链为结构元件,含132个氨基酸,其中强碱性氨基酸18个,强酸性氨基酸19个,疏水氨基酸45个,不带电荷的极性氨基酸32个;含有6个蛋白激...

• 单位
  西北农林科技大学; 国家肉牛改良中心