PCR-CTPP在DNA碱基切除修复基因SNP分型中的应用

作者：彭杨; 程燚; 杨宇馨; 李崇义; 李梦侠; 张诗珩; 王东

来源：重庆医学, 2016, 45(16): 2226-2228.

• 多态性,单核苷酸
• 两对引物-聚合酶链式反应
• 碱基切除修复途径

目的分析两对引物-聚合酶链式反应(PCR-CTPP)在碱基切除修复(BER)途径基因单核苷酸多态性(SNP)分型中的应用,为发现新的SNP检测方法提供实验依据。方法采用PCR-CTPP扩增BER途径关键蛋白OGG1、XRCC1及APE1 4个常见SNP位点OGG1Ser326Cys、XRCC1Arg399Gln、APE1Asp148Glu及-141T/G(位于启动子区域)的DNA片段,凝胶电泳显像后判读基因型,同时与DNA测序的方式比对各基因位点的准确性。结果 PCR-CTPP方法基因分型结果与DNA测序得到的基因分型结果完全一致。结论 PCR-CTPP技术可靠、快速,其广泛应用能够有助于基因SNP的分型研究。