非洲爪蟾BAFF及其信号通路相关基因的比较生物信息学分析

作者：齐志涛; 张启焕; 黄贝; 王资生; 仇明; 黄金田; 许伟; 王爱民

来源：生物技术, 2011, (04): 1-5.

• 非洲爪蟾
• BAFF
• BAFF受体
• 信号通路
• 生物信息学 Xenopus tropicalis
• BAFF receptors
• signaling pathway
• bioinformatics analysis

目的:对非洲爪蟾BAFF和BAFF信号通路相关基因进行了分析。方法:采用生物信息学方法对两栖类重要的模式生物-非洲爪蟾的基因组和EST数据库进行分析。结果:非洲爪蟾BAFF cDNA全长为557 bp,编码218个氨基酸。与人BAFF序列相似性为37.5%。该文一共得到了14个BAFF信号通路相关基因。通过与人BAFF信号通路进行比较,对非洲爪蟾这14个BAFF信号通路相关基因进行了分析。结论:BAFF和BAFF信号通路在进化过程中较为保守,这为进一步研究低等脊椎动物BAFF功能和信号通路具有重要的指导作用。

• 单位
  盐城工学院; 生物工程学院; 中国科学院水生生物研究所; 淡水生态与生物技术国家重点实验室