NDV感染的HeLa细胞的外泌体microRNA的表达谱及生物信息学分析

作者：周昌娈; 丁铲; 孟春春; 孙英杰; 仇旭升; 廖瑛; 刘炜炜; 宋翠萍; 谭磊^*

来源：中国动物传染病学报, 2021, 29(06): 42-49.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.2021.06.004

• 外泌体
• microRNA
• HeLa
• 表达谱
• 生物信息学

分析经NDV感染HeLa细胞分泌外泌体microRNA表达变化,以期为外泌体microRNA在NDV感染中的具体作用机制提供初步的理论基础。采用经典差速离心法分离提取对照组与NDV感染组的HeLa细胞来源外泌体,经miRCURYTM Array芯片分析两组microRNA的表达谱后,通过Targetscan预测表达差异miRNA的可能靶基因,并利用DAVID、KEGG等在线预测工具对差异microRNA靶基因进行Go功能分析。相比于对照组,NDV感染组HeLa细胞外泌体中共有234个microRNA发生了2倍以上的表达差异(P<0.01),其中8个外泌体microRNA呈现出10倍以上的表达差异(P<0.01),分别为hsa-miR-3662、hsa-miR-3128、hsa-miR-345-5p、hsa-miR-376a-3p、hsa-miR-106b-3p、hsa-miR-133b、hsa-miR-410-3p和hsa-miR-454-3p。经Go功能分析发现,这8个microRNA主要分布在细胞外膜、高尔基膜、细胞核膜等部位,参与转录过程,负调节RNA聚合酶Ⅱ启动子转录过程,蛋白质均聚过程,正调节NF-kappaB转录因子活性过程、细胞缺氧反应过程、神经元分化过程等,并发挥着蛋白结合、金属离子结合、转录因子活性、染色体结合等功能。NDV感染会引发HeLa细胞的外泌体microRNA显著性差异表达,而其机制仍有待进一步研究。

• 单位
  中国农业科学院上海兽医研究所