辣椒β–酮脂酰辅酶A合酶基因家族的鉴定与表达分析

作者：易婷; 张志硕; 汤冰倩; 谢玲玲^*; 邹学校^*

来源：园艺学报, 2020, 47(02): 370-380.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0574

• 辣椒
• KCS基因家族
• 基因表达

为深入了解β–酮脂酰辅酶A合酶(β-ketoacyl-CoAsynthase,KCS)基因家族在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定所有KCS基因家族成员,对基因染色体定位、系统发育关系、基因结构、蛋白保守基序和组织表达模式等进行分析,并通过qRT-PCR方法检测基因在高温、低温和NaCl胁迫下的响应。从辣椒基因组中共鉴定出22个KCS家族基因,其不均匀地分布在辣椒的9条染色体上;系统发育分析表明辣椒KCS基因家族可分为4组,每组含有不同数量的基因;该家族成员含有0～3个内含子,保守基序有6～14个;KCS家族基因具有不同的表达模式;高温、低温和NaCl处理可以抑制或激活该家族成员的表达。

• 单位
  湖南农业大学; 湖南大学; 湖南省蔬菜研究所