基于生物信息学分析CDH6基因在胃癌组织中的表达及临床意义

作者：孟静静; 崔敏; 周而乐; 李红; 曹璋^*

来源：科技视界, 2022, (11): 9-12.

DOI：10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2022.11.02

• CDH6
• 上皮间充质转化
• 胃癌
• TCGA

目的：钙粘附素家族成员cadherin-6 (CDH6)异常激活与多种癌症的发生发展密切相关，本研究利用生物信息学技术分析CDH6在胃癌中的表达情况及功能。方法：从癌症基因组图谱-胃腺癌（TCGA-STAD）数据集获得RNA转录本数据及临床数据，比较不同分组间CDH6的表达水平。使用Cox回归分析和Kaplan-Meier法评估CDH6表达对胃癌预后的意义。使用c BioPortal筛选TCGA-STAD中与CDH6共表达的基因并对其进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。使用基因集富集分析（GSEA）分析与CDH6表达相关的标志基因集。使用CIBERSORT和TIMER分析CDH6与免疫细胞浸润和免疫相关基因之间的相关性。结果：CDH6在胃癌中高表达并与胃癌的恶性程度呈正相关。CDH6高表达是胃癌不良预后的独立危险因素，与较差的总生存期相关。胃癌中CDH6功能富集主要与肿瘤的浸润、转移相关，标志基因集富集主要与上皮间充质转化相关。胃癌中CDH6的表达与多种免疫细胞及免疫相关基因相关。结论：CDH6的表达可能被多种免疫细胞释放的炎症因子所调控，进而通过EMT过程在胃癌的发生发展中发挥作用，是胃癌潜在的不良预后标志物和免疫治疗靶点基因。

• 单位
  滨州市人民医院; 滨州医学院