银屑病易感基因的生物信息分析

作者：郑文新; 刘红; 汪伟^*

来源：医学信息(上旬刊), 2018, 31(21): 1-5.

DOI：10.3969/j.issn.1006-1959.2018.21.001

• 银屑病
• 易感基因
• 蛋白质相互作用网络
• 富集分析

目的分析银屑病易感基因的功能,筛选关键基因。方法结合OMIM数据库以及近年来发表的文章收集银屑病易感基因,利用Gather在线服务对易感基因进行富集分析,蛋白质相互作用网络由String数据库构建,计算节点的度数,据此筛选关键易感基因。结果银屑病的易感基因功能主要富集在免疫应答,防御反应,生物应激反应,有机生理过程,应激反应,对害虫寄生虫病原体的反应,对外部生物刺激的反应,对外伤的反应,抗原表达,抗原呈递及抗原加工等类别。我们通过计算易感基因所编码的蛋白质相互作用网络中节点的度数,按度数的高低,选出排在前十的10个基因,作为关键易感基因,功能分析和通路分析提示关键基因和很多功能明确与银屑病相关的基因相互作用。结论易感基因分析提示,银屑病是与环境因素密切相关,具有遗传性的免疫性皮肤病。蛋白质相互作用网络分析提示,关键易感基因可以没有明确的功能,但是会和很多与银屑病相关功能明确的基因相互作用。

• 单位
  中心实验室; 首都医科大学; 生物医学工程学院