摘要

穗发芽(PHS)是造成小麦、水稻等主要农作物产量和品质损失的重要因素。水稻SD6基因是bHLH家族转录因子,负调控水稻休眠,该基因编码区第1 857 bp处的核苷酸单碱基T至C突变导致水稻产生穗发芽抗性。为提高SD6基因在育种中的选择效率,本研究根据功能SNP (Single nucleotide polymorphism)位点设计和筛选出四引物扩增受阻突变PCR (Tetra-primer ARMS-PCR)功能标记。利用此功能标记对不同水稻品种和‘Kasalath’/‘9311’的F2群体进行基因检测,结合测序分析验证,仅需一次PCR扩增能够快速鉴定穗发芽SD6Nip基因纯合体、抗穗发芽SD6Kasa基因纯合体和杂合体,且具有高通量、操作简单、成本低的特点。本研究开发的功能标记为通过MAS方法利用SD6基因培育抗穗发芽水稻新品种提供了技术支撑。