军府制是清朝政府在新疆实行的军政合一的行政管理制度。阿克苏办事大臣是清代新疆军府制中的重要组成部分。方志和《清实录》新疆资料辑录是研究清代新疆政治制度的重要史料,本文从方志、《清实录》新疆资料辑录等史料入手,整理分析清代新疆军府制设置及层级,分析阿克苏办事大臣的设立及驻地的设置和迁移历程,论述其历史作用,进而加强对阿克苏办事大臣职能的认识。