摘要
目的 采用生物信息学方法预测EB病毒BZLF1基因编码蛋白的结构、抗原表位及疫苗的初步构建,为EB病毒相关疾病的疫苗的研制提供依据。方法 通过NCBI获得EB病毒BZLF1蛋白的核苷酸序列和氨基酸序列,采用ORF Finder、Protparam、SOPMA、DTU Health Tech、TMHMM-2.0、Cell-PLoc 2.0、NetPhos 3.1 Servera、NetNGlyc、SWISS MODE、Immunomedicine Group、IEDB、BLAST、Uniprot等生物信息学软件对EB病毒BZLF1蛋白的理化性质、亲疏水性、结构域、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化及糖基化位点、二级结构、三级结构、抗原决定簇、B细胞与T细胞抗原表位、蛋白同源性及相互作用蛋白进行预测分析。在T4DNA连接酶作用下连接BZLF1基因与穿梭表达载体pMV261,对连接产物进行PCR及双酶切鉴定。结果 BZLF1蛋白是由245个氨基酸组成的亲水蛋白,分子式为C1185H1850N332O366S8,相对分子质量为26.860×103,理论等电点为5.25,脂肪族氨基酸指数为71.35,平均亲水系数为-0.529;该蛋白二级结构以无规则卷曲居多,占51.84%,无信号肽和跨膜区,存在18个磷酸化位点,2个糖基化位点,含有1个碱性亮氨酸拉链结构。预测该蛋白有9个抗原决定簇,8个B细胞优势抗原表位,9个CTL细胞优势表位,8个Th细胞表位,与人类环状amp反应元件结合蛋白相似度为6.12%,同源性较低。PCR及双酶切鉴定含BZLF1基因的pMV261载体构建正确。结论 生物信息学预测BZLF1属于亲水蛋白,热稳定性较好。该蛋白含有多个磷酸化位点可参与相关信号通路,对疾病的发展起到重要作用。BZLF1含有多个B、T细胞抗原表位,且与人体蛋白同源性低,不易发生免疫交叉反应,可作为EB病毒候选疫苗表位。
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单位济宁医学院; 基础医学院