乳中不同体细胞数的新疆褐牛STAT5B基因表达及生物信息学分析

作者：刘攀; 姜徽; 巨星; **; 田月珍; 付雪峰; 李媛媛; 苟穆荣; **; 樊琛; 布佐拉姑丽·库尔班; 黄锡霞^*

来源：中国畜牧杂志, 2022, 58(02): 106-112.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20210428-10

• 新疆褐牛
• STAT5B
• RT-qPCR
• 生物信息学分析
• 体细胞数

新疆褐牛是我国育成的首个乳肉兼用牛品种,具有抗逆性强、体细胞数低、耐粗饲的优点,拥有西北第一牛的美称。前人研究发现,STAT5B基因与新疆褐牛的泌乳性状有关,为了进一步探索STAT5B基因对新疆褐牛泌乳性状的影响,通过采用实时荧光定量PCR技术(RT-q PCR)对STAT5B基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量进行分析;同时使用NCBI Blast、Prot Param、Prot Scale、SOPMA、SWISS-MODE、MEGA、TMHMM Server v.2.0、Signal P-5.0 Server、WoLF PSORT等生物信息学分析软件对STAT5B基因编码的蛋白进行结构分析与功能预测。RT-q PCR结果表明:STAT5B基因对奶牛乳房炎影响不显著,但STAT5B基因在健康新疆褐牛血液中的表达量高于患乳房炎的新疆褐牛。生物信息学分析结果表明:STAT5B基因编码蛋白的分子式为C4006H6263N1111O1197S25,共编码787个氨基酸;进化树分析结果表明牛STAT5B基因与水牛的亲缘关系较为接近;经预测STAT5B基因编码的蛋白质是一种亲水性蛋白,主要由亮氨酸组成;该蛋白中α-螺旋高达50.95%,β-折叠的含量最少。该分析及预测结果主要为探索新疆褐牛STAT5B基因的功能奠定基础,为阐明其对新疆褐牛泌乳性状的影响提供了理论依据。

• 单位
  新疆畜牧科学院; 新疆农业大学; 动物科学学院