芥菜全基因组中Hsf基因家族鉴定与分析

作者：**; 唐兵; 谭国飞; 付文苑; 王青青; 曾庆鸿; 王洪亮; 马建云; 张睿; 施绍斌; 邓英^*

来源：四川农业大学学报, 2023, 41(02): 295-306.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.202208163

• 芥菜
• 热激转录因子
• 生物信息学
• 表达分析

【目的】通过鉴定与分析芥菜基因组中Hsf转录因子家族成员，为芥菜Hsf基因功能研究与遗传改良提高抗逆性提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法分析芥菜Hsf热激转录因子家族成员的功能结构、保守基序、启动子顺式作用元件、系统进化、共线性及采用RNA-seq验证Hsf低温胁迫的基因表达。【结果】芥菜基因组中鉴定出71个Hsf基因家族成员，分布于18条染色体上，归类为3个亚家族，蛋白均含有DBD和HR-A/B结构域。BjuHsf启动子区域包含与逆境胁迫、激素、生长发育等相关顺式作用元件。系统进化与共线性分析表明，芥菜Hsf家族成员与大白菜Hsf家族成员具有更近的亲缘关系。在低温胁迫下，BjuHsf基因表达分析表明8个BjuHsf基因显著上调表达。【结论】这些显著差异表达BjuHsf基因与芥菜抗寒性极其相关，可作为芥菜耐寒性遗传改良的候选基因。

• 单位
  贵州省园艺研究所; 贵州省农业科学院