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摘要
为确定中药前胡（Peucedanum praeruptorum Dunn）叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因，本研究利用Codon W 1.4.2、CUSP以及Excel等软件对筛选出的53条蛋白编码序列进行中性绘图分析、PR2-plot和ENC-plot分析显示，RSCU值＞1的密码子有30个，其中有29个以A/U结尾，说明前胡叶绿体基因组的同义密码子更偏好以A/U结尾。而密码子的各项指标（ENC值， CAI值， CBI值及GC含量）均显示前胡叶绿体基因组的密码子偏好性较弱。通过中性绘图、ENC-plot分析以及PR2-plot分析发现，影响前胡叶绿体基因组密码子偏好性的主要因素是自然选择。经过筛选最终确定UCA、AGU、ACC、AAU、CGU和AGA为最优密码子。本研究为前胡的叶绿体基因工程、系统进化及环境适应等研究提供依据，同时为前胡属植物系统分类以及资源的开发与利用等方面的研究提供一定的理论参考。
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单位云南省天然药物药理重点实验室; 昆明医科大学
