基于IRAP标记的沙子空心李遗传多样性评价及指纹图谱构建

作者：王贵; 李蕊蕊; 吴茂宏; 任菲宏; 王丽丽; 乔光^*

来源：华中农业大学学报, 2023, 42(01): 1-11.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2023.01.001

• 沙子空心李
• 种质资源
• 分子标记
• IRAP
• 指纹图谱
• 遗传多样性
• 种质创新

通过走访调查，选取92株具有优良性状的沙子空心李种质，根据李反转录转座子的RT序列开发IRAP标记引物，设计L16(43)的正交试验优化10μL IRAP-PCR主要影响因素的含量；利用18条IRAP引物对92份沙子空心李进行遗传多样性分析，构建供试种质的指纹图谱。结果显示：最优的10μL IRAP-PCR反应体系为10-5 mol/L IRAP引物l.3μL,PCR Mix 5.0μL、模板DNA(30 ng/μL) l.0μL,PCR循环40次。18条IRAP引物共扩增出189个位点，多态性位点180个，等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数和Shannon指数均值分别为1.930、1.426、0.261及0.405。采用邻接法将92份沙子空心李聚类为4个类群。确定IRAP引物Ty3-2及Ty3-6为核心引物，可高效构建92份供试种质的指纹图谱。

• 单位
  农业科学院; 贵州大学; 生命科学学院; 贵州省农业科学院