利用WGCNA对受白粉菌侵染后的拟南芥转录组差异基因分析

作者：尚鸿运; 高志勇^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(20): 6734-6742.

DOI：10.13271/j.mpb.018.006734

• 加权基因共表达网络
• 拟南芥
• 白粉菌
• 转录组

加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法。为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块。筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因。功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联。其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路。

• 单位
  杂交水稻国家重点实验室