一株鸡源性沙门氏菌的基因组分析

作者：宋晟; 张海韵; 郭焜鹏; 王芳斌^*

来源：生命科学研究, 2021, 25(03): 268-275.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.03.0136

• 沙门氏菌
• 全基因组测序
• 生物信息学分析

为研究生鲜鸡肉中沙门氏菌的基因组信息,了解其耐药机制与致病机制,从新鲜鸡肉中分离出一株沙门氏菌FC10727,采用Illumina HiSeq 4000和PacBio对其进行全基因组测序与生物信息学分析。结果表明,FC10727基因组大小为4 638 420 bp,预测有4 016个基因, GC含量为54.15%。通过注释eggNOG数据库,对应基因有944个,按功能可分为20类;通过比对KEGG数据库,得到2 981个基因,共参与24类代谢通路;通过比对GO数据库,得到2 901个基因,按基因功能可分为42类;通过比对CAZy数据库,得到96个基因,共分为5类。此外,数据库分析结果提示,该菌株共有耐药基因14个,具有β-内酰胺类药物耐药性等多种耐药机制;致病基因27个,携带系统性红斑狼疮致病基因及多种致病因子。

• 单位
  湖南省食品质量监督检验研究院