辣椒CMB1基因克隆与表达分析

作者:张明先; 张芮豪; 李平平; 吴睿; 周慧丹; 邓明华; 吕俊恒*
来源:广东农业科学, 2023, 50(11): 50-58.
DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2023.11.005

摘要

【目的】CMB1基因在植物的花序结构和果实成熟调控中发挥重要作用,但有关辣椒CMB1基因的功能和调控机制鲜有报道,因此研究辣椒中调控类胡萝卜素合成相关的转录因子及CMB1基因在辣椒中的作用,为辣椒选育提供参考。【方法】以皱皮红、皱皮黄两种辣椒果实为试验材料,利用同源序列法克隆CMB1的编码序列并对其进行生物学信息分析,通过实时荧光定量PCR技术分析CMB1在红色与黄色辣椒果实中不同发育时期(绿熟期、转色期、完熟期)的表达模式。【结果】皱皮红与皱皮黄辣椒的CMB1基因ORF长度均为732 bp,可编码243个氨基酸残基。序列比对发现,皱皮红CMB1碱基序列的第11个位点发生突变,G突变为T,导致氨基酸序列由G(甘氨酸)突变为V(缬氨酸)。生物信息学分析显示,皱皮红CMB1编码蛋白的分子质量为20 923.21,理论等电点为5.59,不稳定系数为57.28,亲水性总平均值(重力)指数为-1.001;皱皮黄CMB1编码蛋白的分子质量为27 958.47,理论等电点为7.10,不稳定系数为53.54,亲水性总平均值(重力)指数为-0.809。皱皮红和皱皮黄的CMB1均为不稳定的疏水蛋白,含有38个磷酸化位点,无跨膜结构和信号肽,具有典型的MADS-box结构域和K-box结构域。进化分析结果发现,辣椒CMB1与茄科的亲缘关系最近,与豆科亲缘关系最远。荧光定量结果显示,CMB1在辣椒果实绿熟期、转色期、完熟期3个时期的表达量依次递增,且3个时期CMB1的表达量在皱皮红中均显著高于皱皮黄。【结论】辣椒CMB1是MADS-box家族的成员,为不稳定的疏水蛋白,在辣椒果实中的表达量与辣椒中类胡萝卜素的积累趋势相似,推测CMB1主要参与调控辣椒红素等类胡萝卜素的合成。

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