甘蓝型油菜开花期全基因组关联分析及开花基因标记开发

作者：王茹梦; 刘忠松^*

来源：分子植物育种, 2021, 19(10): 3329-3338.

DOI：10.13271/j.mpb.019.003329

• 甘蓝型油菜(Brassica napus)
• 开花时间
• 候选基因
• 分子标记

随着南方稻-稻-油三熟制种植模式的推进和油菜机械化生产的要求,选育油菜早熟品种是现阶段中国南方油菜育种的重要研究目标。本研究对100份油菜品种进行简化基因组测序并调查开花时间,利用混合线性模型进行全基因组关联分析,进行SNP等位基因间的表型差异分析。结果表明,检测到69个SNP与开花时间显著关联,可以解释13.42%～23.28%的表型变异;检测到674个SNP等位基因间表型均值差异显著,其中有13个SNP位于与开花期相关的基因内;确认有5个SNP与开花时间性状显著有关,且这5个SNP等位基因间的表型差异达到了6.02～19.19 d;在显著关联位点上下游300 kb范围内筛选到的候选基因CLPS3和EBS可能对影响油菜开花时间起着重要作用,CLPS3和EBS特异性标记可以作为开花期的功能标记用于分子标记辅助育种。

• 单位
  作物基因工程湖南省重点实验室; 湖南农业大学