错配修复蛋白在乳腺癌中的表达及意义

作者：高立香; 刘莉; 陈颖; 刘丽敏; 马强; 孙乃英; 杨兴杰^*

来源：诊断病理学杂志, 2023, 30(08): 779-790.

DOI：10.3969/j.issn.1007-8096.2023.08.013

• 乳腺癌
• 错配修复蛋白
• 生信分析
• 免疫组织化学
• 微卫星不稳定

目的 利用生信分析技术联合实验验证探究错配修复蛋白(MMRP)在乳腺癌中的表达情况。方法 收集2017-01—2021-12 136例阳光融和医院浸润性乳腺癌的根治标本和40例乳腺癌旁组织，通过免疫组化方法验证MLH1、PMS2、MSH2及MSH6表达情况，分析错配修复蛋白缺失在乳腺癌与癌旁组织之间的差异及与各临床病理参数的相关性。下载肿瘤基因图谱(TCGA)BRCA(乳腺癌)项目中level 3 HTSeq-FPKM格式的RNAseq数据，将FPKM格式的RNAseq数据转换成TPM格式并进行log2转化，应用Wilcoxon rank sum test分别比较正常对照和癌组织之间MLH1、PMS2、MSH2及MSH6表达的差异，应用“ggplot2”包(版本3.3.3)绘图。结果 免疫组化结果证实，MLH1、PMS2、MSH2及MSH6在癌旁组中均未发现错配修复蛋白缺失；而在乳腺癌组中仅发现1例三阴性浸润性导管癌出现MSH2缺失，判定为错配修复蛋白缺失(dMMR),其余乳腺癌组病例均未发现dMMR。dMMR在乳腺癌组织与癌旁组织之间的差异无统计学意义(P=1.000)。dMMR在不同肿瘤发病部位、年龄、肿瘤大小、组织学分型、淋巴结转移情况间差异无统计学意义。分析TCGA数据显示，在乳腺癌中，MLH1、MSH2及MSH6的缺失率明显高于正常组织(P<0.0001),PMS2的缺失率与正常组织之间无明显差异(P=0.505)。结论 PMS2缺失率在乳腺癌组织中很低，与癌旁组织之间具有显著差异，且与生信分析结果一致，而MLH1、MSH2及MSH6在乳腺癌中的缺失率与生信分析结果均具有差异性，其原因有待于进一步探讨。