甲型H3N2流感病毒基因特征全基因组测序分析

作者：曹蓝; 李魁彪; 陈艺韵; 吴迪; 曾庆; 夏丹; 刘艳慧; 狄飚; 张周斌^*

来源：中国公共卫生, 2022, 38(03): 302-308.

• H3N2流感
• 全基因组
• 基因进化
• 变异

目的通过对H3N2流感病毒进行全基因组序列基因特征分析,为H3N2流感的科学防控提供研究数据。方法选取2019年广东省广州市13株H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,通过生物信息学软件分析各基因特征。结果各基因核苷酸同源性最低为94%,最高为100%,差异最大为NA基因(94%～100%),差异最小为PA基因(98.9%～100%)。各基因核苷酸位点变异率最高为NA基因(8.37%),最低为PA基因(2.14%),不同基因核苷酸变异率差异具有统计学意义(χ2=123.503,P=0.000)。各基因均与疫苗株A/HONG KONG/2671/2019(H3N2)归属于同一进化分支,且来源于门诊监测毒株与暴发疫情毒株进化起源相同。根据流行时间的不同,HA、PB2、PB1、NP、M、NS基因可以继续划分为Group 1–3三个小分支,Group 1分支流行于2019年1—8月,Group 2分支流行于2019年11—12月,Group 3分支同时包含2019年1—8月和2019年11—12月流行期的毒株。结论 2019年广州H3N2流感病毒与疫苗株位属于同一进化分支,不同来源毒株具有相同的进化起源。但全基因组在进化特点、同源性、分子变异率等方面存在基因多样性差异。

• 单位
  广州市疾病预防控制中心