核桃LIM基因家族生物信息学分析

作者：马乃膺; 李建红; 辛国; 张瑞; 张仲兴; 王延秀^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(10): 3221-3228.

DOI：10.13271/j.mpb.021.003221

• 核桃(Juglans regia L.)
• LIM基因家族
• 生物信息分析

LIM (LIN11, Isl1和MEC3)可参与细胞骨架构建、代谢调控以及生物和非生物胁迫等多种生命过程，是真核生物谱系中普遍存在的重要转录因子之一。为深入了解核桃LIM基因家族信息，本研究从核桃全基因组数据库中最终筛选确定了15个LIM基因，利用生物信息学方法对核桃LIM家族进行系统分析。结果表明，15个核桃LIM基因，其氨基酸序列长度介于189～577 aa，理论等电点介于5.56～9.08，分子量介于20.80～65.85 k D，均为疏水性蛋白，主要位于细胞核和叶绿体中，根据进化分析将其分为5个亚族。启动子区顺式作用元件分析表明，该基因家族成员受脱落酸、乙烯、茉莉酸甲酯和水杨酸4种激素调节，并能响应低温逆境。本研究基于核桃全基因组分析，鉴定出15个LIM基因家族成员，系统分析了理化性质、基因结构、染色体定位及顺式作用元件，为进一步探索核桃LIM基因家族在核桃树体响应逆境胁迫的生物学功能提供了参考依据。

• 单位
  陇南市经济林研究院核桃研究所; 甘肃农业大学; 甘肃省林业科学技术推广总站