高等院校办学形式日益多元化,完善内部控制评价体系成为紧要任务。高校内部控制评价体系是保证内部控制效率与效果的基础。文章针对现阶段高校内部控制评价体系存在的问题展开分析,即在评价体系运用、监督机制、评价报告利用等方面存在的问题,从组织结构、评价体系、人员素质、监督体系、信息披露等方面提出了合理建议。