自然垄断行业政府管制引入合作治理,可以促使企业主动提高生产效率,而且简化了管制程序,降低了管制难度。但在制度不完善的情况下,合作治理的引入,将面临管制俘获和信任考验的困境。困境的化解需要针对政府管制机构、企业和公众等治理主体进行制度完善。主要是强化政府管制机构的独立性、专业性、信任体系和问责机制建设,健全企业产权制度并强化企业的守法责任和信息公开责任,加强公众参与合作治理的制度构建等。